Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYC3

Tmem39a, Transmembrane protein 39A, mousemouse

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Length 486 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39aQ9CYC3 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem39aQ9CYC3 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem39aQ9CYC3 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem39aQ9CYC3 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem39aQ9CYC3 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem39aQ9CYC3 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem39aQ9CYC3 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem39aQ9CYC3 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem39aQ9CYC3 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem39aQ9CYC3 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem39aQ9CYC3 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem39aQ9CYC3 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem39aQ9CYC3 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem39aQ9CYC3 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem39aQ9CYC3 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem39aQ9CYC3 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem39aQ9CYC3 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem39aQ9CYC3 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem39aQ9CYC3 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem39aQ9CYC3 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem39aQ9CYC3 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem39aQ9CYC3 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem39aQ9CYC3 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem39aQ9CYC3 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem39aQ9CYC3 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem39aQ9CYC3 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem39aQ9CYC3 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem39aQ9CYC3 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem39aQ9CYC3 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem39aQ9CYC3 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem39aQ9CYC3 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem39aQ9CYC3 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem39aQ9CYC3 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem39aQ9CYC3 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem39aQ9CYC3 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem39aQ9CYC3 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem39aQ9CYC3 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem39aQ9CYC3 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem39aQ9CYC3 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem39aQ9CYC3 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem39aQ9CYC3 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem39aQ9CYC3 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem39aQ9CYC3 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem39aQ9CYC3 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem39aQ9CYC3 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem39aQ9CYC3 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem39aQ9CYC3 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem39aQ9CYC3 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem39aQ9CYC3 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem39aQ9CYC3 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem39aQ9CYC3 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem39aQ9CYC3 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem39aQ9CYC3 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem39aQ9CYC3 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem39aQ9CYC3 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Tmem39aQ9CYC3 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem39aQ9CYC3 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem39aQ9CYC3 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem39aQ9CYC3 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Tmem39aQ9CYC3 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Tmem39aQ9CYC3 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Tmem39aQ9CYC3 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem39aQ9CYC3 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem39aQ9CYC3 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem39aQ9CYC3 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem39aQ9CYC3 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem39aQ9CYC3 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem39aQ9CYC3 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem39aQ9CYC3 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem39aQ9CYC3 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem39aQ9CYC3 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem39aQ9CYC3 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem39aQ9CYC3 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem39aQ9CYC3 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem39aQ9CYC3 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem39aQ9CYC3 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem39aQ9CYC3 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tmem39aQ9CYC3 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tmem39aQ9CYC3 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tmem39aQ9CYC3 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tmem39aQ9CYC3 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tmem39aQ9CYC3 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tmem39aQ9CYC3 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tmem39aQ9CYC3 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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