Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms