Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Commd4Q9CQ02 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms