Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Gm7103-201ENSMUST00000195642 1852 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Gphn-201ENSMUST00000052472 3570 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Clock-201ENSMUST00000075159 7478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Cacna1c-202ENSMUST00000078320 8062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Ppm1f-201ENSMUST00000027373 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Speer4b-201ENSMUST00000053257 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Smarcc2-203ENSMUST00000105235 4032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Klhl22-202ENSMUST00000120488 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Hmbox1-201ENSMUST00000022544 3396 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Gm37806-201ENSMUST00000194524 6387 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Arfgap3-201ENSMUST00000067215 2619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Chd1-201ENSMUST00000024620 3196 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Gripap1-201ENSMUST00000065932 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Clip3-201ENSMUST00000014065 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Zfp658-201ENSMUST00000005597 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Gm10425-201ENSMUST00000181085 3364 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Gm7357-201ENSMUST00000195361 2991 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Gm4884-201ENSMUST00000164422 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Cx3cl1-201ENSMUST00000034230 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Tubb5-201ENSMUST00000001566 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Myo18a-201ENSMUST00000000645 7307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Ubash3a-201ENSMUST00000048656 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Epn2-204ENSMUST00000108713 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Wwtr1-202ENSMUST00000120977 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Rbp1-201ENSMUST00000052068 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Wnk1-224ENSMUST00000203030 8163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Zfp512-201ENSMUST00000076264 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Henmt1-203ENSMUST00000106586 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Zc3hav1-202ENSMUST00000114898 3052 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Gm16387-201ENSMUST00000180990 2632 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Nkx2-2os-201ENSMUST00000136998 4345 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 AC121574.1-201ENSMUST00000228770 3132 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 4933407K13Rik-203ENSMUST00000138943 4364 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Fam161a-201ENSMUST00000058269 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Btrc-206ENSMUST00000224102 3037 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Oprm1-216ENSMUST00000105611 2420 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms