Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Gm5395-201ENSMUST00000121650 915 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 C030013C21Rik-201ENSMUST00000133400 795 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Tmem242-202ENSMUST00000185896 780 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Gm33707-201ENSMUST00000195135 569 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Ggta1-201ENSMUST00000044255 1221 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Atp5g3-202ENSMUST00000111996 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Gm14717-201ENSMUST00000140450 649 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Gm13412-201ENSMUST00000150621 677 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Dedd-202ENSMUST00000097467 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Gm23439-201ENSMUST00000104292 132 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Mrps36-203ENSMUST00000109333 701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Gm16209-201ENSMUST00000118457 627 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Gm10171-201ENSMUST00000126220 628 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Gm26313-201ENSMUST00000157770 308 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Tex33-202ENSMUST00000165170 1072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Mir6387-201ENSMUST00000184042 108 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Gm37851-201ENSMUST00000193871 889 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Clec2h-202ENSMUST00000204416 386 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Prrg2-211ENSMUST00000211337 676 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Abracl-203ENSMUST00000218994 425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Tex33-201ENSMUST00000074380 1147 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Gm10233-201ENSMUST00000089275 628 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Mcpt4-201ENSMUST00000043249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Hmox1-201ENSMUST00000005548 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms