Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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