Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8N3

Vwc2, Brorin, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwc2Q8C8N3 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms