Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms