Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAR7

Ssxb10, MCG68110, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb10Q6XAR7 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssxb10Q6XAR7 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssxb10Q6XAR7 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssxb10Q6XAR7 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssxb10Q6XAR7 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssxb10Q6XAR7 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssxb10Q6XAR7 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssxb10Q6XAR7 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssxb10Q6XAR7 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssxb10Q6XAR7 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssxb10Q6XAR7 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssxb10Q6XAR7 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssxb10Q6XAR7 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssxb10Q6XAR7 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssxb10Q6XAR7 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssxb10Q6XAR7 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssxb10Q6XAR7 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssxb10Q6XAR7 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
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Ssxb10Q6XAR7 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssxb10Q6XAR7 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssxb10Q6XAR7 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssxb10Q6XAR7 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssxb10Q6XAR7 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssxb10Q6XAR7 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssxb10Q6XAR7 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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Ssxb10Q6XAR7 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssxb10Q6XAR7 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssxb10Q6XAR7 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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Ssxb10Q6XAR7 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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Ssxb10Q6XAR7 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssxb10Q6XAR7 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssxb10Q6XAR7 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssxb10Q6XAR7 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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Ssxb10Q6XAR7 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssxb10Q6XAR7 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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Ssxb10Q6XAR7 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssxb10Q6XAR7 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssxb10Q6XAR7 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssxb10Q6XAR7 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssxb10Q6XAR7 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssxb10Q6XAR7 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssxb10Q6XAR7 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssxb10Q6XAR7 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssxb10Q6XAR7 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssxb10Q6XAR7 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssxb10Q6XAR7 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssxb10Q6XAR7 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssxb10Q6XAR7 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssxb10Q6XAR7 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssxb10Q6XAR7 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssxb10Q6XAR7 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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