Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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