Protein–RNA interactions for Protein: Q60676

Ppp5c, Serine/threonine-protein phosphatase 5, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp5cQ60676 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ppp5cQ60676 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms