Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 AU041133-202ENSMUST00000201286 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Arhgap6-204ENSMUST00000112129 2487 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Gpr35-202ENSMUST00000064480 3409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Zfp780b-201ENSMUST00000081618 3004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm17980-201ENSMUST00000217977 2349 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Avil-203ENSMUST00000129173 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Pax6-204ENSMUST00000111083 2370 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Fgf1-202ENSMUST00000115582 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Zfp775-201ENSMUST00000061720 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Sept9-204ENSMUST00000106349 2932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Rab27a-201ENSMUST00000034722 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 A1cf-201ENSMUST00000075838 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Arfgap3-202ENSMUST00000226124 2461 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms