Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Vma21-201ENSMUST00000114575 4290 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 A430105I19Rik-201ENSMUST00000059997 4703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Clip3-201ENSMUST00000014065 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Slc19a1-208ENSMUST00000136925 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Tacr1-202ENSMUST00000203775 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Slc27a5-201ENSMUST00000032539 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 St3gal6-207ENSMUST00000137035 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Pop1-201ENSMUST00000052290 3395 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Rnh1-201ENSMUST00000106033 2091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Kif1a-204ENSMUST00000171796 8206 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Trim9-205ENSMUST00000221041 3767 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Agbl2-201ENSMUST00000037206 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Dctn1-204ENSMUST00000113918 4321 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Lhfpl2-201ENSMUST00000054274 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Arfgap3-202ENSMUST00000226124 2461 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Dnajc10-201ENSMUST00000028392 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Helz-202ENSMUST00000100305 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Ppfia1-202ENSMUST00000182226 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Mllt10-201ENSMUST00000028076 4917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Cux1-211ENSMUST00000176745 2831 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Tet3-202ENSMUST00000089622 10904 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Tnk2-206ENSMUST00000115125 4313 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Dhtkd1-201ENSMUST00000026924 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Atp6v0a4-202ENSMUST00000114908 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Cr1l-204ENSMUST00000193094 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 1700047M11Rik-202ENSMUST00000189594 2607 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Gm33914-201ENSMUST00000214108 2150 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Thsd7b-201ENSMUST00000040311 3895 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Zc3hav1-202ENSMUST00000114898 3052 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Copb1-201ENSMUST00000033012 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Muc5ac-201ENSMUST00000041924 8256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Tanc1-208ENSMUST00000139863 7246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Anks1b-210ENSMUST00000182113 3553 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Sbno2-201ENSMUST00000042771 4227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Agbl5-201ENSMUST00000069705 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Itgal-203ENSMUST00000118405 3909 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Myo7a-202ENSMUST00000107122 6867 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Adamts13-202ENSMUST00000102891 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Mitf-202ENSMUST00000043637 4881 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Thbs3-202ENSMUST00000119084 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 A1cf-201ENSMUST00000075838 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Pip5k1a-201ENSMUST00000005768 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms