Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR0

Shisa3, Protein shisa-3 homolog, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa3Q3UPR0 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Gm13740-201ENSMUST00000120590 310 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Gm28439-201ENSMUST00000187714 876 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Gm42912-201ENSMUST00000197195 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 BC117090-201ENSMUST00000114850 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Gm15346-201ENSMUST00000143638 475 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Nrxn1-214ENSMUST00000173222 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 AC153912.1-201ENSMUST00000217011 724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 AC154838.2-201ENSMUST00000226602 747 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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