Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Prdm16-205ENSMUST00000105637 8595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Prdm16-201ENSMUST00000030902 8598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms