Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms