Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SmsP97355 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SmsP97355 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
SmsP97355 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SmsP97355 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
SmsP97355 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SmsP97355 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SmsP97355 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
SmsP97355 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
SmsP97355 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
SmsP97355 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
SmsP97355 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
SmsP97355 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SmsP97355 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SmsP97355 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SmsP97355 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SmsP97355 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SmsP97355 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SmsP97355 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SmsP97355 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SmsP97355 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
SmsP97355 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SmsP97355 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SmsP97355 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SmsP97355 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SmsP97355 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SmsP97355 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SmsP97355 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
SmsP97355 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SmsP97355 Pdgfra-202ENSMUST00000168162 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SmsP97355 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SmsP97355 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SmsP97355 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SmsP97355 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SmsP97355 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SmsP97355 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SmsP97355 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SmsP97355 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SmsP97355 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SmsP97355 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SmsP97355 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
SmsP97355 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SmsP97355 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SmsP97355 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SmsP97355 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SmsP97355 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SmsP97355 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SmsP97355 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SmsP97355 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SmsP97355 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SmsP97355 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SmsP97355 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SmsP97355 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SmsP97355 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SmsP97355 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SmsP97355 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SmsP97355 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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SmsP97355 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SmsP97355 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SmsP97355 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SmsP97355 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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SmsP97355 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SmsP97355 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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SmsP97355 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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SmsP97355 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SmsP97355 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
SmsP97355 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SmsP97355 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SmsP97355 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SmsP97355 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SmsP97355 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
SmsP97355 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SmsP97355 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SmsP97355 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SmsP97355 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SmsP97355 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SmsP97355 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SmsP97355 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SmsP97355 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SmsP97355 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SmsP97355 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SmsP97355 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SmsP97355 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SmsP97355 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SmsP97355 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms