Protein–RNA interactions for Protein: P97351

Rps3a, 40S ribosomal protein S3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3aP97351 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms