Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Tp53bp1P70399 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Tp53bp1P70399 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Tp53bp1P70399 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Tp53bp1P70399 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Tp53bp1P70399 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Tp53bp1P70399 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Tp53bp1P70399 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Tp53bp1P70399 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Tp53bp1P70399 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Tp53bp1P70399 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms