Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CartptP56388 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CartptP56388 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CartptP56388 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
CartptP56388 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CartptP56388 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CartptP56388 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CartptP56388 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CartptP56388 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CartptP56388 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CartptP56388 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CartptP56388 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CartptP56388 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CartptP56388 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CartptP56388 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CartptP56388 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CartptP56388 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CartptP56388 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CartptP56388 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
CartptP56388 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CartptP56388 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CartptP56388 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CartptP56388 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
CartptP56388 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
CartptP56388 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CartptP56388 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CartptP56388 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CartptP56388 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CartptP56388 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CartptP56388 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CartptP56388 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
CartptP56388 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CartptP56388 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CartptP56388 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
CartptP56388 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CartptP56388 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CartptP56388 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
CartptP56388 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CartptP56388 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
CartptP56388 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
CartptP56388 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
CartptP56388 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
CartptP56388 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
CartptP56388 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
CartptP56388 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CartptP56388 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
CartptP56388 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
CartptP56388 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
CartptP56388 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CartptP56388 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CartptP56388 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
CartptP56388 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CartptP56388 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
CartptP56388 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
CartptP56388 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
CartptP56388 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
CartptP56388 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
CartptP56388 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
CartptP56388 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
CartptP56388 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
CartptP56388 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
CartptP56388 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
CartptP56388 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
CartptP56388 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
CartptP56388 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
CartptP56388 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
CartptP56388 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
CartptP56388 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CartptP56388 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CartptP56388 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CartptP56388 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
CartptP56388 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CartptP56388 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
CartptP56388 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CartptP56388 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CartptP56388 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CartptP56388 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CartptP56388 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CartptP56388 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CartptP56388 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
CartptP56388 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CartptP56388 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CartptP56388 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
CartptP56388 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CartptP56388 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CartptP56388 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CartptP56388 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CartptP56388 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CartptP56388 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CartptP56388 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
CartptP56388 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
CartptP56388 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CartptP56388 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CartptP56388 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CartptP56388 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
CartptP56388 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CartptP56388 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
CartptP56388 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
CartptP56388 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CartptP56388 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms