Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
TgfaP48030 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TgfaP48030 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
TgfaP48030 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
TgfaP48030 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TgfaP48030 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TgfaP48030 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TgfaP48030 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TgfaP48030 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TgfaP48030 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TgfaP48030 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TgfaP48030 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TgfaP48030 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TgfaP48030 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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