Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrprbP47758 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrprbP47758 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SrprbP47758 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrprbP47758 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrprbP47758 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SrprbP47758 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrprbP47758 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms