Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Rps4l-ps-201ENSMUST00000059737 768 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprmP28828 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Adgb-201ENSMUST00000045328 1893 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Lime1-202ENSMUST00000108804 960 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Gm7781-201ENSMUST00000117258 788 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Gm2663-201ENSMUST00000166306 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Mir124-2hg-203ENSMUST00000186923 673 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Cpsf4l-201ENSMUST00000018871 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Gm33969-201ENSMUST00000197615 388 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Gm3926-201ENSMUST00000223378 1123 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Scgb1c1-201ENSMUST00000035300 455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Fam186a-201ENSMUST00000062631 759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprmP28828 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprmP28828 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Slc10a1-201ENSMUST00000095572 1674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Scgb1b29-201ENSMUST00000108094 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Psme2-201ENSMUST00000111378 795 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Gm15476-201ENSMUST00000118247 1191 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Gm25154-201ENSMUST00000157123 119 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Gm9409-201ENSMUST00000197017 316 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprmP28828 AC156633.1-201ENSMUST00000215971 614 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Gm34667-201ENSMUST00000222974 1258 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Ankrd45-201ENSMUST00000052245 849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprmP28828 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprmP28828 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Nxpe1-ps-201ENSMUST00000209981 1454 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Ifna5-201ENSMUST00000102804 570 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Gm14997-201ENSMUST00000119232 636 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Rpl7a-ps12-201ENSMUST00000120384 794 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Gm15258-201ENSMUST00000153801 741 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Gm26379-201ENSMUST00000178125 138 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprmP28828 2700099C18Rik-203ENSMUST00000182475 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Gm4960-201ENSMUST00000182928 1001 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprmP28828 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Gm44173-201ENSMUST00000204316 132 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprmP28828 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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