Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 St7-204ENSMUST00000077080 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Eif2ak4-201ENSMUST00000005233 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Usp45-201ENSMUST00000040429 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Gm20796-201ENSMUST00000180355 5838 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Pigk-204ENSMUST00000159899 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Sik2-206ENSMUST00000176824 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Plxnb3-201ENSMUST00000002079 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Lct-201ENSMUST00000073490 6174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Slitrk1-201ENSMUST00000100322 5359 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Smarcc2-201ENSMUST00000026433 4533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Zzef1-201ENSMUST00000069395 11150 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Ccdc186-202ENSMUST00000118592 6445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Flg2-201ENSMUST00000098884 7011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csn1s1P19228 Zzef1-207ENSMUST00000172220 11249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms