Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Olfr478-202ENSMUST00000210173 2477 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Gm44975-201ENSMUST00000207435 1390 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Gm8988-201ENSMUST00000155015 1240 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 1700065O20Rik-201ENSMUST00000186872 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 2810404M03Rik-201ENSMUST00000188324 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 AC173482.3-201ENSMUST00000225492 1212 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Olfr1447-201ENSMUST00000071484 1113 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
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Hoxb1P17919 H2-M9-202ENSMUST00000087167 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Ssxb3-201ENSMUST00000089374 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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