Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 5930422O12Rik-201ENSMUST00000059351 840 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 P2rx1-202ENSMUST00000092938 1119 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Gm23604-201ENSMUST00000104311 132 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Cav2-203ENSMUST00000115462 694 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Itpa-ps1-201ENSMUST00000117207 597 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Gm13094-201ENSMUST00000117930 409 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Tex33-203ENSMUST00000169575 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Ipcef1-209ENSMUST00000170680 1174 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Gm33707-201ENSMUST00000195135 569 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Cryab-205ENSMUST00000216755 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 AC152169.1-201ENSMUST00000223901 701 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 AC154759.1-201ENSMUST00000224137 1159 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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