Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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