Protein–RNA interactions for Protein: F6YKI2

Gm8220, Predicted gene 8220 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8220F6YKI2 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Abca9-201ENSMUST00000044850 6384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Ipo7-201ENSMUST00000084731 4763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Myom2-201ENSMUST00000033842 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm8220F6YKI2 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms