Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Gm26226-201ENSMUST00000082509 116 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Tesk2-202ENSMUST00000106456 2430 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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