Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Tex101-201ENSMUST00000078001 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Col5a3Q9JLI2 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Col5a3Q9JLI2 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Col5a3Q9JLI2 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Itpa-201ENSMUST00000103193 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Col5a3Q9JLI2 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Col5a3Q9JLI2 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Col5a3Q9JLI2 Gm8643-201ENSMUST00000195228 625 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Ghrl-203ENSMUST00000203588 237 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Col5a3Q9JLI2 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Col5a3Q9JLI2 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Col5a3Q9JLI2 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Col5a3Q9JLI2 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Scnn1g-201ENSMUST00000000221 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Acnat1-201ENSMUST00000095086 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
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Col5a3Q9JLI2 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Dedd-202ENSMUST00000097467 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Skint7-202ENSMUST00000106568 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Col5a3Q9JLI2 1700112K13Rik-201ENSMUST00000141892 701 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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