Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
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Mrpl39Q9JKF7 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Mrpl39Q9JKF7 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Mrpl39Q9JKF7 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Mrpl39Q9JKF7 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Mrpl39Q9JKF7 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Mrpl39Q9JKF7 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Mrpl39Q9JKF7 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Mrpl39Q9JKF7 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Mrpl39Q9JKF7 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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