Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms