Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ccdc97Q9DBT3 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ccdc97Q9DBT3 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ccdc97Q9DBT3 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ccdc97Q9DBT3 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ccdc97Q9DBT3 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Cts7-201ENSMUST00000021892 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ccdc97Q9DBT3 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ccdc97Q9DBT3 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ccdc97Q9DBT3 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Ccdc97Q9DBT3 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Ccdc97Q9DBT3 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
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Ccdc97Q9DBT3 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Ccdc97Q9DBT3 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Adcy6-205ENSMUST00000228566 3707 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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