Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q1

Ribc2, RIB43A-like with coiled-coils protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc2Q9D4Q1 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ribc2Q9D4Q1 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms