Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Phf6Q9D4J7 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Phf6Q9D4J7 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 2310034O05Rik-201ENSMUST00000185221 1107 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Phf6Q9D4J7 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 AC121357.1-201ENSMUST00000227365 608 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf6Q9D4J7 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms