Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT3

Snx10, Sorting nexin-10, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx10Q9CWT3 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx10Q9CWT3 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Snx10Q9CWT3 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx10Q9CWT3 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx10Q9CWT3 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx10Q9CWT3 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx10Q9CWT3 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx10Q9CWT3 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx10Q9CWT3 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms