Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Gm17147-201ENSMUST00000164176 432 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Gm28809-201ENSMUST00000187542 782 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Gm2328-201ENSMUST00000193525 535 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Myo1h-207ENSMUST00000196676 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 4933427E13Rik-201ENSMUST00000044347 381 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Supt4a-201ENSMUST00000093955 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Gm16560-201ENSMUST00000159115 404 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Gm3115-202ENSMUST00000177660 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Gm6337-203ENSMUST00000177662 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Ppp1r2-ps1-201ENSMUST00000178232 621 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Gm3727-202ENSMUST00000178251 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Ppp1r2-ps6-201ENSMUST00000179333 621 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 AC158518.1-201ENSMUST00000216435 320 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 AC154585.1-201ENSMUST00000218917 997 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Tdpoz4-201ENSMUST00000075953 1113 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Rnf216-209ENSMUST00000200607 3704 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Sh3bgrl3-202ENSMUST00000105879 518 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Gm20629-201ENSMUST00000176157 513 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Gm5205-201ENSMUST00000182253 1003 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Gm29595-202ENSMUST00000187954 466 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Gm45808-201ENSMUST00000210701 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Hpf1-201ENSMUST00000037190 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Gm25514-201ENSMUST00000083860 135 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Rdh7-201ENSMUST00000047199 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Rab38-201ENSMUST00000107256 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Saxo2-205ENSMUST00000207693 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Gm5472-201ENSMUST00000178604 1678 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 AC110091.3-201ENSMUST00000213406 1304 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Gm5860-201ENSMUST00000137810 1028 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Gm17231-201ENSMUST00000163186 645 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Dnajc4-202ENSMUST00000179118 840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Gm18299-201ENSMUST00000192026 636 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Gm37872-201ENSMUST00000192362 886 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 1700113A16Rik-203ENSMUST00000200006 563 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Gm43122-202ENSMUST00000202259 526 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Gm45225-201ENSMUST00000206852 1139 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 3830406C13Rik-213ENSMUST00000225294 1191 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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