Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Nit1-203ENSMUST00000111296 1394 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Ifna9-201ENSMUST00000102807 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Ccnb1-ps-201ENSMUST00000155338 1287 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gm6564-201ENSMUST00000075377 619 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Hax1-201ENSMUST00000079724 1139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Atp5g3-202ENSMUST00000111996 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13171-201ENSMUST00000117233 391 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15707-201ENSMUST00000118804 996 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15982-201ENSMUST00000121681 554 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13827-201ENSMUST00000148801 372 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Tex29-204ENSMUST00000166638 561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gm2345-201ENSMUST00000193451 589 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gm29808-201ENSMUST00000194419 468 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp445-205ENSMUST00000214626 1220 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Pigx-212ENSMUST00000215073 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 CT025603.1-201ENSMUST00000224040 448 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 AC156790.2-201ENSMUST00000227115 568 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Cypt12-201ENSMUST00000029080 550 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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