Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Gm6755-201ENSMUST00000100598 864 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Gm6740-201ENSMUST00000100617 864 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Tmem181c-ps-201ENSMUST00000115772 1288 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Gm16209-201ENSMUST00000118457 627 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Gm10171-201ENSMUST00000126220 628 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 2410152P15Rik-201ENSMUST00000137405 871 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Clec2h-202ENSMUST00000204416 386 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Wbp1-209ENSMUST00000205023 716 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Olfr1335-202ENSMUST00000219094 1148 ntAPPRIS P2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Gm32872-201ENSMUST00000220037 205 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Defb29-201ENSMUST00000060598 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Olfr1121-201ENSMUST00000062555 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Klk1b24-201ENSMUST00000073713 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Olfr1335-201ENSMUST00000084313 1148 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Klk1b21-201ENSMUST00000085455 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Gm10233-201ENSMUST00000089275 628 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Gm13192-201ENSMUST00000101199 208 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Nptn-202ENSMUST00000114121 863 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Gm10443-201ENSMUST00000119024 210 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Gm7211-201ENSMUST00000172692 1118 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 2310034O05Rik-201ENSMUST00000185221 1107 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Gsdmcl2-202ENSMUST00000185391 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Gm20568-201ENSMUST00000197129 208 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 AC134913.2-201ENSMUST00000225017 771 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Lrit1Q8K099 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Lrit1Q8K099 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Lrit1Q8K099 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrit1Q8K099 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrit1Q8K099 Teddm3-201ENSMUST00000170665 1346 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrit1Q8K099 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrit1Q8K099 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrit1Q8K099 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrit1Q8K099 Gm12470-201ENSMUST00000117239 1049 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrit1Q8K099 Gm12009-201ENSMUST00000121361 1100 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrit1Q8K099 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrit1Q8K099 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrit1Q8K099 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrit1Q8K099 Gm25394-201ENSMUST00000157338 133 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrit1Q8K099 Itgb1bp1-202ENSMUST00000172834 801 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrit1Q8K099 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrit1Q8K099 Gm20694-201ENSMUST00000176943 404 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrit1Q8K099 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrit1Q8K099 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrit1Q8K099 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrit1Q8K099 Gm28342-201ENSMUST00000190308 589 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrit1Q8K099 AC163703.1-201ENSMUST00000214133 339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrit1Q8K099 AC117769.1-201ENSMUST00000224716 1120 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrit1Q8K099 2010109A12Rik-201ENSMUST00000031330 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrit1Q8K099 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrit1Q8K099 Rnasek-201ENSMUST00000040428 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrit1Q8K099 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrit1Q8K099 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrit1Q8K099 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrit1Q8K099 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrit1Q8K099 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrit1Q8K099 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrit1Q8K099 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrit1Q8K099 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrit1Q8K099 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrit1Q8K099 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrit1Q8K099 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms