Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Hpf1Q8CFE2 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Hpf1Q8CFE2 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Hpf1Q8CFE2 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Hpf1Q8CFE2 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Hpf1Q8CFE2 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Hpf1Q8CFE2 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Hpf1Q8CFE2 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Hpf1Q8CFE2 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Hpf1Q8CFE2 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Hpf1Q8CFE2 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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Hpf1Q8CFE2 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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