Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Snx8Q8CFD4 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
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Snx8Q8CFD4 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Snx8Q8CFD4 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Snx8Q8CFD4 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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