Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S7

Amigo3, Amphoterin-induced protein 3, mousemouse

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo3Q8C2S7 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 1110034G24Rik-201ENSMUST00000061891 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Gm42858-201ENSMUST00000202512 1704 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Trav13-2-201ENSMUST00000103658 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Gm14639-201ENSMUST00000120850 866 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Sult2b1-207ENSMUST00000210754 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Gm45745-201ENSMUST00000211447 1180 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Gm3137-201ENSMUST00000218177 620 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Fam186a-201ENSMUST00000062631 759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Gm5507-201ENSMUST00000091897 1008 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Slc10a1-201ENSMUST00000095572 1674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Rps18-ps1-201ENSMUST00000120838 459 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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Amigo3Q8C2S7 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Tnfrsf14-205ENSMUST00000219534 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Amigo3Q8C2S7 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Amigo3Q8C2S7 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Amigo3Q8C2S7 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Gm37582-201ENSMUST00000192953 1409 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Cep70-207ENSMUST00000190715 1768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Scgb1b29-201ENSMUST00000108094 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Pxmp4-202ENSMUST00000109703 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Gm5510-201ENSMUST00000117826 486 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Rpl7a-ps11-201ENSMUST00000118791 801 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Gm13688-201ENSMUST00000121557 608 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Gm14148-201ENSMUST00000122433 1008 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Gm15831-201ENSMUST00000156195 516 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Gm16227-201ENSMUST00000160088 563 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Gm17225-201ENSMUST00000172051 497 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Tcl1-203ENSMUST00000175652 535 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1216.2 ms