Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.7 ms