Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gm10046-201ENSMUST00000208208 632 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
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Ubash3bQ8BGG7 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Ubash3bQ8BGG7 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 6120.7 ms