Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Atg4bQ8BGE6 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Atg4bQ8BGE6 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Atg4bQ8BGE6 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms