Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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H2-M10.4Q85ZW8 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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