Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCN3

Ttbk1, Tau-tubulin kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttbk1Q6PCN3 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttbk1Q6PCN3 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttbk1Q6PCN3 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttbk1Q6PCN3 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttbk1Q6PCN3 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttbk1Q6PCN3 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttbk1Q6PCN3 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttbk1Q6PCN3 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttbk1Q6PCN3 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttbk1Q6PCN3 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttbk1Q6PCN3 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttbk1Q6PCN3 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttbk1Q6PCN3 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttbk1Q6PCN3 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttbk1Q6PCN3 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttbk1Q6PCN3 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttbk1Q6PCN3 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttbk1Q6PCN3 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttbk1Q6PCN3 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttbk1Q6PCN3 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttbk1Q6PCN3 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttbk1Q6PCN3 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttbk1Q6PCN3 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttbk1Q6PCN3 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttbk1Q6PCN3 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttbk1Q6PCN3 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttbk1Q6PCN3 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttbk1Q6PCN3 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttbk1Q6PCN3 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttbk1Q6PCN3 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttbk1Q6PCN3 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttbk1Q6PCN3 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttbk1Q6PCN3 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttbk1Q6PCN3 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttbk1Q6PCN3 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttbk1Q6PCN3 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttbk1Q6PCN3 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttbk1Q6PCN3 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttbk1Q6PCN3 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttbk1Q6PCN3 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttbk1Q6PCN3 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttbk1Q6PCN3 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttbk1Q6PCN3 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttbk1Q6PCN3 Gm6216-201ENSMUST00000182390 687 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttbk1Q6PCN3 Gm38233-201ENSMUST00000194259 807 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttbk1Q6PCN3 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttbk1Q6PCN3 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttbk1Q6PCN3 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttbk1Q6PCN3 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttbk1Q6PCN3 Ccdc30-203ENSMUST00000084307 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttbk1Q6PCN3 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttbk1Q6PCN3 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttbk1Q6PCN3 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttbk1Q6PCN3 CAAA01216754.1-201ENSMUST00000215882 1836 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Ttbk1Q6PCN3 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ttbk1Q6PCN3 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ttbk1Q6PCN3 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ttbk1Q6PCN3 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttbk1Q6PCN3 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttbk1Q6PCN3 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttbk1Q6PCN3 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttbk1Q6PCN3 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttbk1Q6PCN3 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttbk1Q6PCN3 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttbk1Q6PCN3 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttbk1Q6PCN3 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttbk1Q6PCN3 Gm23439-201ENSMUST00000104292 132 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttbk1Q6PCN3 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttbk1Q6PCN3 Gm16228-201ENSMUST00000162286 809 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttbk1Q6PCN3 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttbk1Q6PCN3 Zcwpw2-203ENSMUST00000187803 372 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttbk1Q6PCN3 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttbk1Q6PCN3 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttbk1Q6PCN3 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttbk1Q6PCN3 Gm26901-202ENSMUST00000193106 256 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttbk1Q6PCN3 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttbk1Q6PCN3 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttbk1Q6PCN3 Clec1b-201ENSMUST00000032262 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttbk1Q6PCN3 Rpl22l1-201ENSMUST00000043867 552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttbk1Q6PCN3 Mir341-201ENSMUST00000093593 96 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttbk1Q6PCN3 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttbk1Q6PCN3 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttbk1Q6PCN3 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttbk1Q6PCN3 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttbk1Q6PCN3 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttbk1Q6PCN3 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttbk1Q6PCN3 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttbk1Q6PCN3 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttbk1Q6PCN3 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttbk1Q6PCN3 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttbk1Q6PCN3 Klk1b5-201ENSMUST00000074359 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttbk1Q6PCN3 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttbk1Q6PCN3 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttbk1Q6PCN3 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttbk1Q6PCN3 Mir705-201ENSMUST00000102058 82 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttbk1Q6PCN3 Cenpx-204ENSMUST00000106155 700 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttbk1Q6PCN3 Srp14-202ENSMUST00000110862 587 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttbk1Q6PCN3 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttbk1Q6PCN3 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttbk1Q6PCN3 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms