Protein–RNA interactions for Protein: Q61818

Rai1, Retinoic acid-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai1Q61818 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rai1Q61818 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rai1Q61818 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rai1Q61818 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rai1Q61818 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rai1Q61818 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rai1Q61818 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rai1Q61818 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rai1Q61818 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rai1Q61818 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rai1Q61818 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rai1Q61818 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rai1Q61818 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rai1Q61818 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rai1Q61818 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rai1Q61818 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rai1Q61818 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rai1Q61818 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rai1Q61818 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rai1Q61818 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rai1Q61818 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rai1Q61818 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rai1Q61818 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rai1Q61818 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rai1Q61818 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rai1Q61818 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rai1Q61818 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rai1Q61818 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rai1Q61818 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rai1Q61818 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rai1Q61818 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rai1Q61818 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rai1Q61818 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rai1Q61818 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rai1Q61818 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rai1Q61818 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rai1Q61818 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rai1Q61818 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rai1Q61818 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rai1Q61818 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rai1Q61818 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rai1Q61818 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rai1Q61818 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rai1Q61818 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rai1Q61818 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rai1Q61818 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rai1Q61818 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rai1Q61818 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rai1Q61818 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rai1Q61818 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rai1Q61818 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rai1Q61818 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rai1Q61818 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rai1Q61818 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rai1Q61818 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rai1Q61818 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rai1Q61818 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rai1Q61818 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rai1Q61818 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rai1Q61818 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Rai1Q61818 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Rai1Q61818 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rai1Q61818 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Rai1Q61818 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rai1Q61818 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rai1Q61818 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rai1Q61818 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rai1Q61818 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rai1Q61818 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rai1Q61818 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rai1Q61818 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rai1Q61818 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rai1Q61818 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rai1Q61818 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rai1Q61818 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rai1Q61818 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rai1Q61818 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rai1Q61818 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rai1Q61818 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rai1Q61818 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rai1Q61818 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rai1Q61818 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rai1Q61818 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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