Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Gm45587-201ENSMUST00000211548 765 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gm45210-201ENSMUST00000206401 1577 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 2310040G07Rik-202ENSMUST00000145897 462 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gm15680-201ENSMUST00000161597 465 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gm37005-201ENSMUST00000193281 1164 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 AC168059.2-201ENSMUST00000224473 333 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Elobl-201ENSMUST00000061938 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Speer4c-201ENSMUST00000095005 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Speer4d-201ENSMUST00000095006 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms