Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mdc1Q5PSV9 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mdc1Q5PSV9 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mdc1Q5PSV9 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mdc1Q5PSV9 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mdc1Q5PSV9 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mdc1Q5PSV9 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mdc1Q5PSV9 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mdc1Q5PSV9 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mdc1Q5PSV9 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mdc1Q5PSV9 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mdc1Q5PSV9 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mdc1Q5PSV9 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mdc1Q5PSV9 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mdc1Q5PSV9 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mdc1Q5PSV9 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mdc1Q5PSV9 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mdc1Q5PSV9 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mdc1Q5PSV9 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mdc1Q5PSV9 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mdc1Q5PSV9 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mdc1Q5PSV9 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mdc1Q5PSV9 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mdc1Q5PSV9 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Mdc1Q5PSV9 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mdc1Q5PSV9 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mdc1Q5PSV9 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mdc1Q5PSV9 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mdc1Q5PSV9 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mdc1Q5PSV9 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mdc1Q5PSV9 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mdc1Q5PSV9 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mdc1Q5PSV9 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mdc1Q5PSV9 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mdc1Q5PSV9 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mdc1Q5PSV9 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mdc1Q5PSV9 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mdc1Q5PSV9 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mdc1Q5PSV9 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mdc1Q5PSV9 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mdc1Q5PSV9 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Mdc1Q5PSV9 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mdc1Q5PSV9 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mdc1Q5PSV9 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mdc1Q5PSV9 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mdc1Q5PSV9 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mdc1Q5PSV9 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mdc1Q5PSV9 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mdc1Q5PSV9 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mdc1Q5PSV9 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mdc1Q5PSV9 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mdc1Q5PSV9 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mdc1Q5PSV9 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mdc1Q5PSV9 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mdc1Q5PSV9 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Mdc1Q5PSV9 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mdc1Q5PSV9 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mdc1Q5PSV9 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mdc1Q5PSV9 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mdc1Q5PSV9 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mdc1Q5PSV9 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mdc1Q5PSV9 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mdc1Q5PSV9 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mdc1Q5PSV9 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mdc1Q5PSV9 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mdc1Q5PSV9 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mdc1Q5PSV9 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mdc1Q5PSV9 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mdc1Q5PSV9 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Mdc1Q5PSV9 Mir326-201ENSMUST00000083637 95 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mdc1Q5PSV9 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mdc1Q5PSV9 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mdc1Q5PSV9 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mdc1Q5PSV9 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mdc1Q5PSV9 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mdc1Q5PSV9 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mdc1Q5PSV9 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mdc1Q5PSV9 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mdc1Q5PSV9 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mdc1Q5PSV9 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mdc1Q5PSV9 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mdc1Q5PSV9 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mdc1Q5PSV9 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Mdc1Q5PSV9 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mdc1Q5PSV9 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mdc1Q5PSV9 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mdc1Q5PSV9 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mdc1Q5PSV9 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Mdc1Q5PSV9 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mdc1Q5PSV9 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mdc1Q5PSV9 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mdc1Q5PSV9 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mdc1Q5PSV9 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Mdc1Q5PSV9 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mdc1Q5PSV9 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mdc1Q5PSV9 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mdc1Q5PSV9 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mdc1Q5PSV9 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mdc1Q5PSV9 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mdc1Q5PSV9 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms